Segundo as instruções da Segurança Social, 

"Incapacidade Temporária por doença profissional é um benefício pago em dinheiro ao trabalhador com suspeita de doença profissional, durante um período de tempo limitado, pela perda ou redução da capacidade de trabalho ou de ganho resultante dessa doença."

No Cegid Cloudware Business, um desconto referente a uma incapacidade temporária deverá ser processado com a introdução de uma alteração no mês no colaborador em questão. 

Tal alteração deverá ser introduzida pelo menu Empresa > Salários > Processamento > Alterações, Processamentos e Encerramentos da seguinte forma:

O código a utilizar deverá ser o D025 - Desconto ao vencimento que permite a introdução manual do valor, do correspondente.

Caso pretenda alterar a descrição do código aplicado para o recibo de vencimento, antes da introdução da alteração no mês, poderá proceder à duplicação e à edição do mesmo. Saiba como, aqui.